Das gemeinsame Sekretariat der Gemeinschaft ist ein Verwaltungs- und Koordinierungsorgan. Es besteht aus einem Konsilium von drei Sekretären, die die beteiligten Mitglieder vertreten und für die Ausübung der Funktion eine Vollmacht besitzen. Der Sitz des Sekretariates befindet sich in Liberec.
Euroregion NisaU Jezu 525/4
460 01 Liberec IV – Perštýn
Das Sekretariat koordiniert die Tätigkeit aller Organe und Foren und erledigt die die Organe der Gemeinschaft betreffenden Angelegenheiten.
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Markus Köhler
Sekretär der deutschen Seite
Geschäftsführer der Euroregion Neisse e. V.
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Jaroslav Zámečník
Sekretär der tschechischen Seite
Sekretär der Euroregion NisaE-Mail: j.zamecnik@centrum.cz
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Tomasz Śliwa
Sekretär der polnischen Seite
Sekretär der Euroregion Nysa